海南医科大学体育部前身为海南医永盈会体育投注基础部体育教研室，2003年成立体育部，目前下设行政办公室、教研办公室、球类教研室、民族传统项目教研室、休闲养生教研室、精品课程教研室、大学生体质健康监测中心、运动设施与赛事管理中心8个三级部门。
学校现有完善的体育场地设施，其中室外场地有标准田径运动场1个，天然草坪足球场1个，灯光篮球场6个，排球场5个，沙滩排球场2个，网球场2个。室内场馆子文体育馆包含羽毛球场8个，乒乓球训练室，瑜伽室，健身房，水上急救中心（游泳馆），风雨操场等。
体育部现有教职工36人，其中专任教师31人，行政人员2人，教辅1人，工勤人员2人。专任教师中具有正高级职称5人、副高级职称18人，中级8人，博士6人，硕士学位23人，学士9人，专任教师中硕士及以上学历的比例达到了74%。师资队伍结构的持续优化，满足了体育教学、科研等工作的需要。根据中共中央办公厅、国务院办公厅印发的《关于全面加强和改进新时代学校体育工作的意见》，体育部结合我校实际情况，更新教学计划， 在大一第1学期进行太极拳与身体素质锻炼方法的通识课教育，在第2、3、4学期开设足球、篮球、排球、气排球、乒乓球、羽毛球、网球、健身健美、啦啦操、游泳、跆拳道、舞龙、健美操、瑜伽、普拉提、形体、极限飞盘、高尔夫、散打、健身气功20门选项课课程。同时将体育教学延伸到课外，成立多个课外体育活动俱乐部，推行校园健康跑，利用运动世界软件监控学生每天锻炼情况，打造课内外一体化的教学模式。
体育部立足学校办学定位与师生健康需求，以体育文化建设为抓手，构建起覆盖师生的体育文化体系，助力“大健康”格局构筑，让“人人参与，人人出彩”成为校园新风尚。深耕“以体强身，以体启智，以体铸魂，以体育人”的育人理念，以运动会和特色活动月为载体，将体育文化融入人才培养全过程，集中推出足球联赛、排球赛、篮球赛、羽毛球赛、乒乓球赛、啦啦操赛等精品赛事，形成了多层次、广覆盖的体育竞赛格局。这些赛事不仅为学生提供了展示运动技能、切磋交流的舞台，更在竞技比拼中锤炼了学生的意志品质、培养了团队协作精神，让学生在强健体魄的同时，启迪智慧、塑造品格，实现体育与德育、智育的有机融合。在职工体育文化建设方面，体育部强化与学校工会的协同联动，推出形式多样的职工运动赛事，赛事涵盖足球、篮球、羽毛球等多个热门项目，兼顾竞技性与趣味性，既满足不同年龄段职工的运动偏好，又为教职工搭建了交流互动、舒缓压力的平台，有效激发了教职工参与体育锻炼的积极性，营造出劳逸结合、互助共进的工作生活氛围，进一步凝聚了校园向心力。
